About us
Clinical Metagenomics for Infectious Diseases We are an interdisciplinary team that is creating new tools to diagnose infectious diseases in humans utilizing next generation DNA sequencing (Ion Torrent -Life Technologies and MySeq -Illumina) combined with ultra-fast algorithms. Due to the increased yield and ever decreasing costs of DNA sequencing we are now able to inexpensively and efficiently find nucleic acids from microbes within normally sterile human bio-fluids. We envision a $50 global assay for infectious agents using this technology and we have concerted efforts to decrease the time to result. |  |
Metagenómica Clínica Para el Diagnostico de Enfermedades Infecciosas Somos un grupo interdisciplinario de investigadores que estamos desarrollando nuevas herramientas para el diagnostico de enfermedades infecciosas en humanos combinando técnicas de secuenciación de última generación (NGS, por sus siglas en Inglés) (Ion Torrent -Life Technologies and MySeq -Illumina) con algoritmos ultra-rápidos para el análisis de datos. Gracias al incremento en la eficiencia y calidad de los datos obtenidos mediante secuenciación y a la disminución de los costos de operación, ahora somos capaces de identificar y cuantificar ácidos nucleicos microbianos circulando en bio-fluidos que son normalmente estériles en ausencia de procesos infecciosos. Nuestra visión es generar un test diagnostico de $50 dólares usando esta tecnología, para lo cual ya hemos concentrado esfuerzos en disminuir el tiempo requerido para el análisis de datos. |
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| Faculty/Profesores: | |
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-Frederick Vannberg, PhD (Georgia Tech)
[Weblink] |
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| Students/Estudiantes: | |
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Working in Experimental Clinical Design and Implementing Sequencing Technologies Working in Ultra-fast algorithm development and Data Analysis |
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